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mRNAシーケンス解析

トランスクリプトームシーケンシング(mRNA-Seq)は、ハイスループット技術を用いて、特定の期間のゲノムからのRNAの存在と量を明らかにするスナップショット技術であり、ライフサイエンス研究に新たな視点を提供し、遺伝子構造、選択的スプライシング、その他の転写修飾の予測、異なる条件下での各転写物の発現レベルの定量化を可能にします。 HaploXは、トータルRNAを抽出し、mRNAのポリ(A)テールの構造的特徴を利用して捕捉し、cDNAに逆転写してライブラリーを構築します。これにより、差次的に発現する遺伝子や機能エンリッチメント解析サービスを提供することができ、遺伝子発現の制御メカニズムの理解を深め、重要な遺伝子やパスウェイを特定し、生物学的プロセスを解析するのに役立ちます。

    ワークフロー

    ワークフロー

    受託サービスの強み

    遺伝子発現解析、遺伝子発現レベルの差の検出、既知の転写産物の検出、未知の転写産物の発見

    捕捉に特定のプローブを必要とせず、未知の生物種ゲノムの包括的なトランスクリプトーム解析が可能

    豊富なプロジェクト経験

    短納期

    サービス仕様

    シーケンス範囲 mRNA
    リード長 PE150
    推奨データ量 6Gb
    データ品質 Fastq ファイル、 Q30≥85%
    データ解析 標準解析
    納期 QC合格後20営業日

    サンプル要件

    サンプル種類推奨濃度最低濃度サンプル量RIN28s/18s OR 23s/16s OR DV200その他の要件
    Total RNA(動物) ≥65ng/μl ≥50ng/μl ≥400ng RIN≥6.5 28s/18s≥1 DNA、タンパク質コンタミなし、過剰な5sなし、無色透明でべたつかないサンプル
    Total RNA(昆虫) ≥20ng/μl ≥20ng/μl ≥1μg N/A
    Total RNA(植物) ≥20ng/μl ≥20ng/μl ≥1μg RIN≥6.5 28s/18s≥1
    オリゴDNA濃縮mRNA ≥6ng/μl ≥6ng/μl ≥30ng Main band>1kb