全ゲノムシークエンシング(WGS: Whole Genome Sequencing)とは、生物の全ゲノムDNA配列を網羅的に解析するハイスループットシーケンシング技術です。HaploXは、高度なハイスループットシーケンサー(illumina NovaSeq 6000、NovaSeq X Plus、DNBSEQ-T20)を活用し、一塩基多型(SNP)、挿入欠失(InDel)、コピー数変異(CNV)、構造的変異など、ゲノム内のあらゆる種類の遺伝的変異を包括的かつ正確に検出します。この技術は、基礎研究、疾患研究、進化生物学、個別化医療の分野において広く利用されており、ゲノムの構造と機能の深い理解、遺伝的多様性の探索、疾患関連変異の発見、精密医療の開発に役立ちます。
複数のサンプルタイプ(FFPE, cfDNA, ctDNA)
PCR/PCRフリーライブラリ作成が利用可能
最低100ng DNAインプット
高度解析とカスタマイズされた解析が提供可能
シーケンス範囲 | 全ゲノム領域 |
リード長 | PE150 |
推奨データ量 | 90Gb/サンプル |
データ品質 | Fastqファイル、Q30≥85% |
データ解析 | 標準解析 |
納期 | QC合格後25営業日 |
サンプル種類 | 濃度 | 推奨量 | 最低量 | バンド | その他の要件 |
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gDNA | ≥12.5ng/μL | ≥1μg | ≥200ng | メインバンド>10kb | タンパク質、RNAコンタミがなく、無色透明;べたつかない |
FFPE DNA | ≥10ng/μL | ≥500ng | ≥400ng | 1000bp以上のバンド>50 % |