product

動植物全ゲノムリシーケンス解析

(WGRS)

動植物全ゲノムリシーケンシング(WGRS: Whole Genome Resequencing)とは、植物や動物の全ゲノムをリシーケンシングし、その配列をリファレンスゲノムの配列と比較分析を行うハイスループットシーケンス技術です。HaploXは、先進的なハイスループットシーケンサー(illumina NovaSeq 6000、NovaSeq X Plus、DNBSEQ-T20)を使用してシーケンシングを行います。得られたシーケンスデータをリファレンスゲノムと比較することにより、一塩基多型(SNP)、挿入欠失(InDel)、構造変異など、ゲノムの中の遺伝子変異を特定し、その特徴を明らかにします。この技術は、動植物の育種、進化生物学、生態学、保全遺伝学の分野で広く利用されており、ゲノムの多様性の解明、遺伝的特性の分析、品種の改良、絶滅危惧種の保護などに利用でき、動植物の科学研究に包括的かつ詳細なゲノム情報を提供します。

    ワークフロー

    ワークフロー

    受託サービスの強み

    複数のサンプルタイプ(FFPE, cfDNA, ctDNA)

    PCR/PCRフリーライブラリ作成が利用可能

    最低100ng DNAインプット

    高度解析とカスタマイズされた解析が提供可能

    サービス仕様

    シーケンス範囲 全ゲノム領域
    リード長 PE150
    推奨データ量 10x-30x
    データ品質 Fastqファイル、 Q30≥85%
    データ解析 標準解析
    納期 QC合格後25営業日

    サンプル要件

    サンプル種類濃度推奨量最低量バンドその他の要件
    gDNA ≥12.5ng/μL ≥1μg ≥200ng メインバンド>10kb タンパク質、RNAコンタミがなく、無色透明;べたつかない
    FFPE DNA ≥10ng/μL ≥500ng ≥400ng 1000bp以上のバンド>50 %