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miRNA解析

miRNAシーケンシング(MicroRNA sequencing)は、マイクロRNA分子の配列および発現パターンを網羅的に解析し、特定するために使用される高度なハイスループットシーケンシング技術です。miRNAは、20~24塩基(nt)長の1本鎖RNA分子であり真核生物において遺伝子の転写後発現調節に関与します。

    HaploXは、miRNAの3'末端と5'末端の特殊な構造とポリアクリルアミドゲル電気泳動法(PAGE)を利用してmiRNAライブラリを作成し、illuminaプラットフォームを使用してシーケンシングします。 miRNAシーケンシングにより、異なるサンプル中のmiRNAの種類と存在量を正確に検出することができ、異なる生物学的プロセスや疾患状態における作用メカニズムを明らかにすることができます。

      ワークフロー

      ワークフロー

      受託サービスの強み

      高感度

      包括的なカバレッジ

      バイアスフリー解析

      サービス仕様

      シーケンス範囲 miRNA
      リード長 PE150
      推奨データ量 3Gb (10M reads)
      データ品質 Fastqファイル, Q30≥85%
      データ解析 標準解析
      納期 QC合格後30営業日

      サンプル要件

      サンプル種類推奨濃度最低濃度最低量RIN28s/18s OR 23s/16s OR DV200その他の要件
      Total RNA(動物) ≥65ng/μl ≥50ng/μl ≥400ng RIN≥6.5 28s/18s≥1 DNA、タンパク質コンタミなし、過剰な5sなし、無色透明でべたつかないサンプル
      Total RNA(昆虫) ≥150ng/μl ≥50ng/μl ≥1μg N/A
      Total RNA(植物) ≥180ng/μl ≥50ng/μl ≥1μg 28s/18s≥1
      Total RNA(原核生物) ≥180ng/μl ≥100ng/μ ≥3μg 23s/16s≥1