miRNAシーケンシング(MicroRNA sequencing)は、マイクロRNA分子の配列および発現パターンを網羅的に解析し、特定するために使用される高度なハイスループットシーケンシング技術です。miRNAは、20~24塩基(nt)長の1本鎖RNA分子であり真核生物において遺伝子の転写後発現調節に関与します。
HaploXは、miRNAの3'末端と5'末端の特殊な構造とポリアクリルアミドゲル電気泳動法(PAGE)を利用してmiRNAライブラリを作成し、illuminaプラットフォームを使用してシーケンシングします。 miRNAシーケンシングにより、異なるサンプル中のmiRNAの種類と存在量を正確に検出することができ、異なる生物学的プロセスや疾患状態における作用メカニズムを明らかにすることができます。
高感度
包括的なカバレッジ
バイアスフリー解析
シーケンス範囲 | miRNA |
リード長 | PE150 |
推奨データ量 | 3Gb (10M reads) |
データ品質 | Fastqファイル, Q30≥85% |
データ解析 | 標準解析 |
納期 | QC合格後30営業日 |
サンプル種類 | 推奨濃度 | 最低濃度 | 最低量 | RIN | 28s/18s OR 23s/16s OR DV200 | その他の要件 |
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Total RNA(動物) | ≥65ng/μl | ≥50ng/μl | ≥400ng | RIN≥6.5 | 28s/18s≥1 | DNA、タンパク質コンタミなし、過剰な5sなし、無色透明でべたつかないサンプル |
Total RNA(昆虫) | ≥150ng/μl | ≥50ng/μl | ≥1μg | N/A | ||
Total RNA(植物) | ≥180ng/μl | ≥50ng/μl | ≥1μg | 28s/18s≥1 | ||
Total RNA(原核生物) | ≥180ng/μl | ≥100ng/μ | ≥3μg | 23s/16s≥1 |