メタゲノムシーケンシング（Metagenome Sequencing）は、微生物群集のゲノムを研究するために使用されるハイスループットシーケンシング技術です。 個々の微生物を分離・培養することなく、環境サンプル（土壌、水、ヒト腸内など）から直接DNAを抽出し、配列決定と解析を行うことができます。

HaploXは、NovaSeq X Plus、NovaSeq6000などのプラットフォームでハイスループットシーケンス解析サービスを提供し、1サンプルで十分なデータ量を得ることができます。 データ解析により、微生物の種類、群集構造、機能、環境との相互作用などの情報が得られます。環境科学、医学、農業、バイオテクノロジーなどの分野の研究に利用できます。