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微生物全ゲノムシーケンス解析

微生物全ゲノムシーケンシングは、単一の微生物コロニー(細菌または真菌)の全ゲノムをシーケンシングして分析するゲノミクスアプローチです。 このアプローチは従来のメタゲノムシーケンスやアンプリコンシーケンスとは異なり、環境サンプル内の微生物群集全体ではなく、個々の微生物の遺伝情報に焦点を当てます。 単一細菌のリシーケンスは、より高解像度の遺伝情報を提供し、複雑なサンプル組成に伴う分析上の課題を回避することができます。

    HaploXは、NovaSeq X Plus、NovaSeq6000、NextSeqなどのプラットフォームを用いて、高品質のシーケンスデータを取得し、それを解析することで、単一細菌の変異に関する情報を得ることができ、病原体の病原因子、抗生物質耐性遺伝子、環境微生物の代謝機能に関する研究をサポートします。

      ワークフロー

      ワークフロー

      受託サービスの強み

      多様なプラットフォームが選択可能

      短納期

      サービス仕様

      シーケンス範囲 ゲノムワイド
      リード長 PE150
      推奨シーケンス深度

      バクテリア ≥100X

      真菌 ≥50X

      データ品質 Fastq ファイル, Q30≥85%
      データ解析 標準解析
      納期 QC合格後30営業日

      サンプル要件

      サンプル種類濃度推奨量最低量バンドその他の要件
      WGS ≥12.5ng/μL ≥1μg ≥200ng メインバンド>10kb タンパク質、RNAコンタミがなく、粘着性のあるシルクを含まない無色透明なサンプル