微生物全ゲノムシーケンシングは、単一の微生物コロニー(細菌または真菌)の全ゲノムをシーケンシングして分析するゲノミクスアプローチです。 このアプローチは従来のメタゲノムシーケンスやアンプリコンシーケンスとは異なり、環境サンプル内の微生物群集全体ではなく、個々の微生物の遺伝情報に焦点を当てます。 単一細菌のリシーケンスは、より高解像度の遺伝情報を提供し、複雑なサンプル組成に伴う分析上の課題を回避することができます。
HaploXは、NovaSeq X Plus、NovaSeq6000、NextSeqなどのプラットフォームを用いて、高品質のシーケンスデータを取得し、それを解析することで、単一細菌の変異に関する情報を得ることができ、病原体の病原因子、抗生物質耐性遺伝子、環境微生物の代謝機能に関する研究をサポートします。
多様なプラットフォームが選択可能
短納期
シーケンス範囲 | ゲノムワイド |
リード長 | PE150 |
推奨シーケンス深度 | バクテリア ≥100X 真菌 ≥50X |
データ品質 | Fastq ファイル, Q30≥85% |
データ解析 | 標準解析 |
納期 | QC合格後30営業日 |
サンプル種類 | 濃度 | 推奨量 | 最低量 | バンド | その他の要件 |
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WGS | ≥12.5ng/μL | ≥1μg | ≥200ng | メインバンド>10kb | タンパク質、RNAコンタミがなく、粘着性のあるシルクを含まない無色透明なサンプル |