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全エクソームシーケンス解析

(WES)

全エクソームシーケンシング(WES: Whole Exome Sequencing)は、シーケンスキャプチャー法を用いてエクソームDNAを濃縮し、全ゲノムシーケンシングに代わる費用対効果の高い手法を提供します。HaploXは、学術分野で広く認知されている市販のキャプチャープローブ(Agilent、IDT、Rocheなど)でエクソン濃縮し、先進的なシーケンサー(Illumina NovaSeq 6000、NovaSeq X Plus)を利用してシーケンス解析サービスを提供します。HaploXの全エクソームシーケンス解析サービスは、より深いカバレッジと高いデータ精度を提供し、疾患関連の遺伝子変異の特定、標的治療のサポート、遺伝子研究に最適です。

    ワークフロー

    ワークフロー

    受託サービスの強み

    高深度

    様々なブランドのプローブが利用可能

    最低100ng DNAインプット

    高度解析とカスタマイズされた解析が提供可能

    サービス仕様

    シーケンス範囲 全ゲノム領域
    リード長 PE150
    推奨データ量 100x (10Gb)/200x(20Gb)
    キャプチャープローブ Agilent v6, Roche v3,IDT v2 and more
    データ品質 Fastq ファイル、Q30≥85%
    データ解析 標準解析
    納期 QC合格後20営業日

    サンプル要件

    サンプル種類濃度推奨量最低量バンドその他の要件
    gDNA ≥12.5ng/μL ≥1μg ≥200ng メインバンド>10kb タンパク質、RNAコンタミがなく、無色透明;べたつかない
    FFPE DNA ≥2.5ng/μL ≥200ng ≥200ng 1000bp以上のバンド>50 %