全エクソームシーケンシング(WES: Whole Exome Sequencing)は、シーケンスキャプチャー法を用いてエクソームDNAを濃縮し、全ゲノムシーケンシングに代わる費用対効果の高い手法を提供します。HaploXは、学術分野で広く認知されている市販のキャプチャープローブ(Agilent、IDT、Rocheなど)でエクソン濃縮し、先進的なシーケンサー(Illumina NovaSeq 6000、NovaSeq X Plus)を利用してシーケンス解析サービスを提供します。HaploXの全エクソームシーケンス解析サービスは、より深いカバレッジと高いデータ精度を提供し、疾患関連の遺伝子変異の特定、標的治療のサポート、遺伝子研究に最適です。
高深度
様々なブランドのプローブが利用可能
最低100ng DNAインプット
高度解析とカスタマイズされた解析が提供可能
シーケンス範囲 | 全ゲノム領域 |
リード長 | PE150 |
推奨データ量 | 100x (10Gb)/200x(20Gb) |
キャプチャープローブ | Agilent v6, Roche v3,IDT v2 and more |
データ品質 | Fastq ファイル、Q30≥85% |
データ解析 | 標準解析 |
納期 | QC合格後20営業日 |
サンプル種類 | 濃度 | 推奨量 | 最低量 | バンド | その他の要件 |
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gDNA | ≥12.5ng/μL | ≥1μg | ≥200ng | メインバンド>10kb | タンパク質、RNAコンタミがなく、無色透明;べたつかない |
FFPE DNA | ≥2.5ng/μL | ≥200ng | ≥200ng | 1000bp以上のバンド>50 % |